Армавирская биофабрика создана по Декрету СНК «О мерах по обеспечению РСФСР прививочными материалами, необходимыми для борьбы с заразными болезнями домашних животных» в 1919 году и уже в августе 1921 года выпустила первую промышленную продукцию: 726 литров иммунокрови против чумы крупного рогатого скота.
Главным результатом первого десятилетия работы коллектива фабрики была ликвидация чумы крупного рогатого скота на Северном Кавказе и действенная помощь в подавлении её очагов в стране. Начиная с 1931-1932 годов, биофабрика расширяет ассортимент продукции: освоен ряд препаратов для борьбы с чумой свиней, рожей свиней, паратифом крупного рогатого скота. Увеличение количества выпускаемой продукции сочеталось с совершенствованием контроля качества биопрепаратов.
ФКП «Армавирская биофабрика» выпускает более восьмидесяти наименований иммунобиологических препаратов, в том числе вакцины участвующие в системе государственного заказа по обеспечению противоэпизодических мероприятий в Российской Федерации.
Более пятнадцати препаратов в настоящее время по долгосрочным контрактам поставляются в страны Ближнего и Дальнего Зарубежья.
С 2002 года на ФКП «Армавирская биофабрика» организовано производство стерильных лекарственных средств медицинского назначения, входящих в перечень жизненно необходимых и важных лекарственных препаратов. Более 25 наименований лекарственных средств производятся в строгом соответствии с Международными требованиями GMP и Российским законодательством.